网站首页/有机动态/实验与测试/JMC | 基于细胞表型的c-Myc小分子抑制剂的发现与优化
JMC | 基于细胞表型的c-Myc小分子抑制剂的发现与优化

内容概述——


2021年初,GSKArvinas公司通过高通量筛选,发现了能够抑制c-Myc及其功能的小分子化合物(GoDesign 3月份有对其进行推送),今年的10月份GSK公司通过细胞中蛋白水平的表型变化对其进一步的优化改造。得到效果较好的化合物17d,其在降低细胞内c-Myc表达水平的pEC50=7.1,又通过结构改造提高其成药性,得到化合物2021。成果发表在Journal of Medicinal Chemistry上“Cell-Based Drug Discovery: Identification and Optimization of Small Molecules that Reduce c‑MYC Protein Levels in Cells”。


——优化策略——


筛选的方法是之前使用过的策略,基于抗体的HTRF来检测内源c-Myc蛋白的表达水平。从之前两百万个化合物库中筛选到的hit 1出发,进行结构优化改造。(图一)                           

图一:hit 1降低c-Myc的蛋白水平和mRNA水平

hit 1的结构进行分析,确认核心骨架为“苯并咪唑——吡啶”这样一个骨架结构。对三个芳香环分别进行官能团衍生构建。(图二)

图二:核心骨架结构

经过不同位点的化合物修饰,设计优化和活性测试,得到药效团模型。三个红色的氢键受体是维持细胞活性的基础;反式的二乙基胺能够有效地提高细胞活性;R5位可能面向结合位点的溶剂面;R4R7可能占据于较小的口袋之中。(图三)

图三:药效团模型

最终筛选到活性较好的化合物17d在细胞内降解c-MycpEC50=7.1,基于17d对其成药性(包括PK PFI和可旋转单键数)进行优化得到了化合物2021。(图四)

图四:基于17d结构对成药性进行优化

文章最后从在动物实验上表征了化合物17d,可以明显地抑制小鼠模型上肿瘤的生长。

图五:17d的动物模型实验


——总结——


GSK公司基于之前的工作,筛选到了细胞表型降低c-Myc表达量的效果更好的化合物,通过结构优化得到化合物17dpEC50=7.1,且能够抑制小鼠模型中肿瘤的生长。但是没有对其标靶位点进行验证,只是基于降解c-Myc的表型进行的筛选和优化。

 

参考文献:

Medina, J. R. et al. Cell-Based Drug Discovery: Identification and Optimization of Small Molecules that Reduce c-MYC Protein Levels in Cells, J. Med. Chem. , (2021). https://doi.org/10.1021/acs.jmedchem.1c01416


纳孚服务
  • 化学试剂
  • 提供稀有化学试剂现货

  • 化学试剂定制合成服务
  • 上海纳孚生物科技有限公司提供市场稀缺的化学试剂定制服务

  • 新材料现货
  • 上海纳孚生物科技有限公司代理或自产包含石墨烯产品,类石墨烯产品、碳纳米管、无机纳米材料以及一些高分子聚合物材料

  • 结构设计及定制合成
  • 可以根据客户需求对所需化合物结构进行设计改性,从而定制合成出客户所需分子式结构

  • 联系我们
  • 021-58952328
  • 13125124762
  • info@chemhui.com
  • 关注我们
在线客服
live chat