分享一篇发表在JACS上的文章，文章标题“Thermostable WW-Domain Scaffold to Design Functional β-Sheet Miniproteins”，文章的通讯作者是来自海德堡大学的Franziska Thomas教授和康斯坦茨大学的Michael Kovermann教授。其中Franziska Thomas课题组致力于多肽设计方面的研究。
微型蛋白是合成生物学或生物材料设计中一类富有前景的蛋白质。它们的序列和结构复杂性相对较低，并且能提供明确的折叠支架。这些特性使得研究人员能够以高度可预测的方式进行工程设计。本文，作者提出了具有高热稳定性的WW结构域支架，并以这一支架作为工程平台，设计得到多种不同结合功能的微型蛋白。WW结构域支架是一种具有三条链的、反向平行β折叠肽。这一类肽大约包含35个氨基酸，并且与富含脯氨酸的肽序列结合。为探索这一类支架的序列-结构关系，同时设计出具有高热稳定性的支架，作者以WW结构域的共有序列（consensus sequence）作为起点；将结构域进一步细化为7个部分，依次针对每个部分的残基进行修改；采取贪婪搜索策略，将结构完整性和热稳定性表现最优者延续至下一轮。经过六轮序列迭代，作者得到Tm值超过90摄氏度的WW结构域肽（超过起始序列约40摄氏度）WW-HS，并总结了这一结构域的某些关键相互作用。考虑到WW结构域的序列可变性较高，作者通过嫁接功能基序的方法分别设计得到能够结合PPxY型富含脯氨酸、结合PPLP/PPRP基序、结合pS/pTP的结构域以及结合Zn离子的结构域。这些离子展示了WW-HS作为广泛的功能性蛋白支架的潜力。原文链接：https://pubs.acs.org/doi/10.1021/jacs.4c03498文章引用：10.1021/jacs.4c03498
