分享一篇发表在Cell Chemical Biology上的文章，题目为“An interactive resource mapping the proteome and reactive cysteine landscape across the NCI-60 reveals cell and tissue-specific profiles”，通讯作者是来自加州大学旧金山分校的Balyn Zaro教授，她主要开发化学生物学和蛋白质组学技术研究天然免疫及进行药物发现。这篇文章中作者绘制了NCI-60细胞系蛋白质组和半胱氨酸反应性图谱。

半胱氨酸是蛋白质组中亲核性最强的氨基酸，可以发挥多种功能，影响蛋白质结构、催化能力及氧化还原相关的信号转导，此外，半胱氨酸还是重要的共价抑制剂靶点。但是，目前对半胱氨酸在不同癌症环境中的反应性的理解仍然不足。

本文分析了人肿瘤细胞系中NCI-60的半胱氨酸反应性，NCI-60细胞系包含59种人癌细胞细胞系，代表着9种不同组织类型。通过蛋白质组学分析，作者使用无标定量手段定量到多于12000种蛋白质，与此前的数据集相比有很好的兼容性，通过基于脱硫生物素定量的化学蛋白质组学方法isoDTB-ABPP，定量到多于36000种反应性半胱氨酸，其中包括多于10000个高反应性位点，展现了与其功能的密切相关性。在不同组织中，作者揭示了半胱氨酸功能保守性，即在多个细胞系中均属于高反应性半胱氨酸的靶点更有可能反映其具有重要功能；然而，只有3%半胱氨酸在所有细胞系中均被定量，有20%半胱氨酸只在一个细胞系中被定量到，揭示了半胱氨酸具有高度的特异性，通过联系蛋白功能，作者揭示了一些潜在的共价药物靶点。

作者将这些数据整理成了一个交互式在线数据库https://cysteine.app/，可供研究人员使用。

本文作者：WYJ

责任编辑：WYQ

DOI：10.1016/j.chembiol.2025.12.003

原文链接：https://doi.org/10.1016/j.chembiol.2025.12.003